共同研究者である東京大学の平池勇雄先生が執筆した論文がSTAR Protoc誌 に掲載されました。
Chromatin immunoprecipitation with mouse adipocytes using hypotonic buffer to enrich nuclear fraction before fixation
STAR Protoc. 2023 Feb 7;4(1):102093. doi: 10.1016/j.xpro.2023.102093. Online ahead of print.
概要
分化した脂肪細胞を用いたクロマチン免疫沈降 (ChIP) 実験は、脂肪滴が免疫沈降効率を妨げるため困難です。ここでは、著者は、ホルムアルデヒド架橋の前に低張緩衝液を使用して核分画を濃縮し、分化した脂肪細胞を用いたChIP実験の感度と特異性を高めることにより、脂肪滴の負担を最小限に抑えるための最適化された手順について説明しています。著者は、超音波処理、免疫沈降、洗浄、逆架橋、精製など、固定後の手順についても説明しています。このプロトコルは、さまざまな転写因子およびヒストン修飾の ChIP-qPCR および ChIP-seq と互換性があります。
キーワード: 細胞生物学; 細胞分化; クロマチン免疫沈降 (ChIP); 代謝。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36825994/
